Kitab Mustadrak Hakim sudah diberikan catatan tambahan dan kajian atas kualitas hadis yang ada di dalamnya oleh al-Zahabi dan ditahqiq oleh Syaikh Musthafa Abdul Qodir Atha, karena sebelum beliau menyelesaikan sudah dipanggil Yang Kuasa.
Banyak ulama yang mengkritik karya Mustadrak al-Hakim, diantaranya:
- Al-Baihaqi: Mustadrak Hakim tidak memuat hadis yang memenuhi persyaratan shahihain.
- Al-Malini: tidak ada hadis shahih pun yang memenuhi syarat shahihain dalam Mustadrak.
- Al-Zahabi: ada separuh yang sesuai dengan syarat Bukhari-Muslim.